Majoritatea bacteriilor au nutritie heterotrofa.. Unele se hranesc cu substante oganice pe care le descompun pana la produsi simpli-bacterii saprofite, iar altele utilizeaza substantele organice din celulele vii, producandu-le diferite boli -bacterii parazite. Un numar mic de bacterii au nutritie autotrofa. Unele au capacitatea de fotosinteza (utilizeaza energia solara), iar altele au capacitatea de chimiosinteza (utilizeaza energia eliberata in urma reactiilor chimice la intuneric).